現代狗的起源可追溯至數萬年前，如今所謂的「純種犬」多半都曾是米克斯，不同品種狗類的血緣關係錯綜複雜，但狼到底是如何變成博美的呢？
如今以性情穩定聞名的家庭寵物，拉布拉多貴賓（labradoodle）是在 1990 年代作為「低致敏導盲犬種」而被發明出來的。此品種的近代起源和混合詞名字，明白顯示牠是拉布拉多和貴賓雜交的混種犬。但其他 400 多個狗狗品種呢——狼到底是如何變成博美犬的？
現代狗類的起源可追溯至數萬年前（約莫 2 萬到 4 萬年間），當時人類馴養了現代狼（生物學上和狗同為犬屬狼種）的古老近親。自那時開始，人們開始刻意、選擇性地雜交育種，最初培育出了專事放牧、狩獵及看守的狗。
接著，迎來了維多利亞時代的繁殖爆炸期。18 世紀中期，狗類育種曾有過一段劇烈創新與分類的時期，這不只帶來了品種多樣性，更促成了「品種」這個概念的誕生。值此時期，不同血統的狗被刻意雜交，以強化討人喜歡的特徵、或淡化不受歡迎的特點。而雜交也顯然為了創造新品種，選出符合美學特色的品種。
這在不同種類的狗之間，創造了一種混亂、交纏的關係，而品種起源的細節，有時只存錄於口述歷史。
直到 2017 年，一份劃時代的基因研究問世，我們才對所有品種彼此間的關聯，有了較為清晰的認識。
美國國家人類基因體研究所（簡稱NHGRI）研究員，分析了 161 個品種的 DNA，創造出一份狗狗品種的族譜。依據牠們共有的歷史，將族譜上的品種分類成群。這些群（或稱「演化支」）反映出：在狗狗的馴養史中，我們對狗狗的認識，只在於牠們為人類提供了什麼樣的服務。負責狩獵的狗是一個家族，包括獵犬和雪達犬；負責放牧的則是形形色色的牧羊犬。
伊蘭‧奧斯傳德博士（Elaine Ostrander）是 NHGRI 癌症遺傳學和比較基因體學部門的負責人，也是上述研究的指導研究員。此研究是 NHGRI 狗類基因體計畫的一部分。
「我們想知道的是，不同品種之間，有著怎樣的關聯？」她說。
「我們知道多數品種是從維多利亞時期才開始出現。當時歐洲一些愛好者想創造出擁有特定樣貌，或特定技巧、性格的品種。」
她說，許多親緣關係都有頗直觀的道理。
「其一重要的是地理位置——那些品種在哪出現，」她說。「功能當然也很重要，而外表相同的狗當然也有關，像是小型和標準雪納瑞。」
「但總會有些驚喜，一些在我們預期之外的發現。」
圖表基於「同源全等單倍型基因共享」，即一種用來測量遺傳自共同祖先、完全相同的 DNA 區段的方法，來顯示品種之間的親緣關係指數：數字 1 為最遠，100 為最近。《衛報》原始文章頁面提供互動圖表，可閱覽所有品種的親緣關係圖。
雜交育種的陰影
此研究也進行分析，揭露隱藏在現代「純種」狗背後，雜交育種的陰影。
雖然所有品種的狗，基因體（所有遺傳物質的總和）都百分之百是狗的DNA，但有少量基因體會因品種而異。這些不同的部分導致了家犬在體型、身形和行為上的巨大差異。研究者在數千個這種變異位置（variable sites）上，進行狗類基因體測序（註）。若兩個不同品種的狗，擁有數個完全相同的基因模塊時，就顯示牠們之間曾有跨品種交配的歷史。
這些新近研究結果確認了一些品種在歷史上的紀錄。此研究論文的第一作者、NHGRI 基因學家海蒂‧帕克（Heidi Parker）表示，這些結果也顯示了未被記錄或預期之外的雜交證據。
「我們發現，德國牧羊犬有不少義大利血統，」她說。「我們到底搞清楚德國牧羊犬實際的來龍去脈了沒，我不知道，只知道牠們是現知與最多對象雜交的品種之一。」
我們使用該份基因研究的資料，將單一品種和 NHGRI 檢驗的其他所有品種之間的親緣關係視覺化（且親緣關係的判定，須超過特定門檻——詳見「附註與方法」）。
在〈表一〉的例子中，你可以看到德國牧羊犬，與義大利的帕拉托雷犬（cane paratore）、法國的皮卡第牧羊犬和美國的奇努克犬共享較大量的 DNA。重點是，圖表並未顯示雜交的定向（天擇或人擇下演化的方向）——只是顯示出兩個品種間親緣的遠近程度（1 至 100）。
「我們不知道這之中的定向性，它只告訴我們，品種之間有過混種和配對，」奧斯傳德說道。
在某些案例中，更久遠的品種歷史也能被證實。傳說中的猛獸，原始的愛爾蘭獵狼犬，曾不見蹤影近百年，並被推斷已然滅絕。1860 年代，喬治‧奧古斯塔斯‧葛拉漢（George Augustus Graham）開始從現存的犬隻譜系中，重新培育愛爾蘭獵狼犬；從蘇格蘭獵鹿犬開始，並少量配種大丹犬，好讓體型變大。（詳見〈表二〉）
而源於中國的巴哥犬的結果則令人驚訝。繁殖者已把少量巴哥犬的基因，散播至全球林林總總的品種當中了，這可能是為了讓這些狗的體型變小。
此研究漏掉的其中一件事，是所謂「設計師品種」，例如黃金貴賓、查理王貴賓和其他各種「ＸＸ貴賓」。
帕克所說，沒放入這些品種，是因為牠們大多都已停止繁衍。「這些品種絕大多數，幾乎全部，都只是一次性地被創造出來，但不會繼續，」她說道。「唯一真的在繼續的是拉布拉多貴賓——澳洲拉布拉多貴賓犬協會（Australian Labradoodle Club）還在繁殖牠們。」
NHGRI 狗類基因體小組特別研究過拉布拉多貴賓，結果顯示，在基因上，牠更接近貴賓犬，而非拉布拉多。
此研究中的一些犬類，比如臘腸狗或灰狼，則與其他品種沒有任何連結。帕克表示，這有幾種可能的解釋。
「我們在這份論文中辨別的共享基因，大約只追溯到200年前，甚或不到200年。有幾個品種，像是臘腸狗和大麥町，在那個時間點便未顯示出任何共享的跡象，」她說。
「這可能代表，這些品種在那個時間點前，就已是如今的形態了，且沒有人認為那個形態有要調整的地方。也有可能，只是我們的資料集中沒有收錄到正確品種，所以沒能看到其他增加（的基因）。」
「那也是我們還持續在為這份族譜添加更多品種的原因之一，尤其是區域性品種，把缺漏的部分補上。」
至於狗類基因體計畫的未來，奧斯特蘭德説，他們在不同品種間進行同樣的分析，並用全基因體進行比對。
「我們亟欲解答的其中一個問題是：差別為何？在這個比之前高上許多倍的解析度之下，你會看見什麼之前看不到的東西？」
‧狗類基因體計畫有意採集更多異國品種犬隻的 DNA 樣本。可聯繫以下電子信箱，瞭解你能否在未來研究中幫上忙：andrew.hogan@nih.gov。
註：DNA 測序是指分析 DNA 片段鹼基序列的排列方式。而基因體測序，就是對單一生物的「所有遺傳物質總和」做 DNA 測序。
附註與方法
根據最小鹼基對與最大鹼基對的尺寸比對，相關性指數僅使用1至100的範圍。且只有比對結果超過25萬鹼基對者，有被涵蓋在原始文章中。